Университет основан в 1958 году как Владивостокский медицинский институт, Постановлением Совета Министров РСФСР №905.
В 1995 году Владивостокский медицинский институт распоряжением Правительства Российской Федерации от 11.09.1992 г. №169-р, приказом Госкомвуза России от 23.06.1995 г. № 953 и приказом Министерства здравоохранения и медицинской промышленности Российской Федерации от 20.07.1995 г. № 209 переименован во Владивостокский государственный медицинский университет. С 2013 года согласно утвержденному приказу Министерства здравоохранения Российской Федерации № 913 от 15 ноября 2012 года, официальное название университета: Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Тихоокеанский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации; в соответствии с уставом вуза, утвержденным приказом Министерства здравоохранения Российской Федерации №442 от 30 июня 2016 г. полное название университета: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Тихоокеанский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
сокращенное: ФГБОУ ВО ТГМУ Минздрава России;
международное: Federal State Budgetary Educational Institution of Higher Education «Pacific State Medical University» of the Ministry of Healthcare of the Russian Federation
международное сокращенное: FSBEI HE PSMU MOH Russia.
В соответствии с распоряжением Правительства Российской Федерации от 10.09.2008 № 1300-р Университет находится в ведении Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации. Учредителем Университета является Российская Федерация. Полномочия Учредителя в настоящее время осуществляет Министерство здравоохранения Российской Федерации.
По организационно-правовой форме Тихоокеанский государственный медицинский университет является федеральным государственным бюджетным образовательным учреждением высшего образования.
Впервые Университет получил лицензию на ведение образовательной деятельности в 1994 г. и далее в 1999 г., 2004 г., 2009 г., 2011 г. Действующая лицензия на право осуществления образовательной деятельности выдана Федеральной службой по надзору в сфере образования и науки РФ от 11 августа 2016 г. № 2333, серия 90Л01 №0009391, срок действия – бессрочно. Университет имеет свидетельство о государственной аккредитации Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки по основным профессиональным образовательным программам №2306 от 25.10.2016., серия 90А01 № 0002428 со сроком действия до 29.12.2020 г. и свидетельство о государственной аккредитации Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки по основным общеобразовательным программам №2307 от 25.10.2016., серия 90А01 № 0002429 со сроком действия до 29.12.2026 г.
На этапе становления вуз осуществлял подготовку по трем специальностям: «лечебное дело», «медико-профилактическое дело» и «педиатрия». В настоящее время в ТГМУ сохраняется принцип непрерывной подготовки медицинских кадров от довузовских форм подготовки с профилизацией преподавания школьников (лицензированы 2 основные: среднее (полное) общее; основное общее, подготовка к поступлению в вуз), подготовка специалистов по программам среднего профессионального и высшего образования. Принцип Болонской конвенции «Образование через всю жизнь» реализуется посредством программ подготовки кадров высшей квалификации в ординатуре и аспирантуре, а так же по программами дополнительного профессионального образования.
При ФГБОУ ВО ТГМУ Минздрава России создан Учебный военный центр (распоряжение Правительства РФ от 6 марта 2008 г. № 275-р).
ФГБОУ ВПО ТГМУ Минздрава России — это ведущий инновационный и образовательный центр Дальневосточного региона. Университет выполняет фундаментальные и прикладные научные исследования по 5 отраслям наук: медицинские науки, биологические науки, психологические науки (медицинская психология), химические науки (биоорганическая химия), экономические науки (экономика и управление народным хозяйством в отрасли здравоохранения). В университете работают 3 Диссертационных совета .
Руководство вузом осуществляли ректора:
- с 1958 по 1970гг. Живодеров Владимир Михайлович
- с 1970 по 1984гг. Тихомиров Александр Сергеевич
- с 1984 по 2007гг. Каминский Юрий Валентинович
- с 20.04.2007 года и по настоящее время управление деятельностью Университета осуществляет Шуматов Валентин Борисович, д.м.н., профессор.