Институт стоматологии был организован 17.09.2018 г. приказом ректора от 22.06.2018 № 262/1-ОД «О внесении изменений в структуру вуза».
Институт стоматологии входит в структуру стоматологического факультета.
История стоматологии в вузе начинается еще с 1984 года, когда существовал курс стоматологии при кафедре госпитальной хирургии, а затем – морской медицины. Курсом бессменно руководил к.м.н., доцент Г.М. Бобков. В 1998 году курс был преобразован в кафедру стоматологии при факультете повышения квалификации (заведующий – к.м.н. И.В. Елистратов).
В это время остро встал вопрос о подготовке и переподготовке стоматологических кадров в Приморском крае. Существовало большое количество заявок из департамента здравоохранения Приморского края и из других регионов Дальнего Востока. Учитывалась сложная обстановка со специалистами врачебного звена. В связи с коммерциализацией стоматологической помощи практически все врачи-стоматологи ушли из государственной службы в частные кабинеты и клиники. От 60 до 80% врачебных стоматологических должностей в муниципальных лечебных организациях занимали зубные врачи, что сказывалось на качестве оказываемой стоматологической помощи населению.
В августе 1999 года был проведен первый набор на коммерческой основе студентов на отделение челюстно-лицевой хирургии при лечебном факультете вуза. А в январе 2000 года появился новый факультет – стоматологический. Его первым деканом стал И.В. Елистратов. На кафедре стоматологии работали доктор медицинских наук, профессор В.А. Воробьев и кандидаты медицинских наук Г.М. Бобков, В.Е. Толмачев, Д.Б. Ларионова. Ими было создано методическое обеспечение, материально-техническая база, заключены договоры о совместной работе с клиниками города. С января 2000 года на стоматологическом факультете происходило постепенное формирование кафедр.
Кафедра ортопедической стоматологии была организована д.м.н., профессором В.А. Воробьевым (1947-2009 гг.). Именно им был сформирован профессорско-преподавательский состав, который и сейчас, практически в том же составе успешно осуществляет учебно-воспитательную, научно-исследовательскую деятельность; обучение ординаторов, аспирантов и врачей по основным разделам ортопедической стоматологии. Автор 47 научных статей и 3 изобретений, академик Тихоокеанской международной медицинской академии. Подготовил 4 кандидатов медицинских наук. С 2009 по 2018 гг. кафедру возглавлял д.м.н., доцент Ю.Ю. Первов
Кафедра терапевтической стоматологии: заведующий кафедрой к.м.н., доцент Д.Б. Ларионова. С 2001 г. по 2008 г. возглавляла стоматологический факультет. Д.Б. Ларионова организовала и возглавляла собственную клиническую базу вуза – стоматологическое отделение вуза. Является автором более 16 печатных работ, на ее творческом счету участие в учебном пособии и монографии.
Кафедра хирургической стоматологии и челюстно-лицевой хирургии была первой кафедрой факультета, заведующий кафедрой к.м.н., доцент В.Е. Толмачев. В.Е. Толмачев был первым заместителем декана, под его руководством были открыты направления челюстно-лицевой хирургии и пластической хирургии.
Кафедра стоматологии детского возраста и ортодонтии, заведующий кафедрой к.м.н., доцент Е.Ю. Русакова. Е.Ю. Русакова являлась первым главным детским стоматологом Приморского края, создала направление ортодонтии на факультете.